В начале XVI столетия образовалось Витебское воеводство, через полвека его разделили на Витебский и Оршанский повет, немногим позже территория воеводства расширилась присоединением Велижской волости. В конце века королем Сигизмундом Третьим Витебску было дано Магдебургское право и первый герб.
В 1623 году витебляне подняли восстание, требуя свободного выбора вероисповедания, когда правителями навязывалось униатство. Был убит униатский архиепископ, за что город понес жестокое наказание. Витебск лишился Магдебургского права, казни подверглись 19 человек, из них 2 бурмистра. Город обязали выплатить более 3 тысяч злотых.
Вернуть право на самоуправление городу удалось в 1654 году. Однако спокойная жизнь Витебска длилась недолго: в 1708 году армия шведов сожгла город в ходе Северной войны.
